2002年最后修訂的《中華人民共和國(guó)水法》第四十八條規(guī)定，“直接從江河、湖泊或者地下取用水資源的單位和個(gè)人，應(yīng)當(dāng)按照國(guó)家取水許可制度和水資源有償使用制度的規(guī)定，向水行政主管部門(mén)或者流域管理機(jī)構(gòu)申請(qǐng)領(lǐng)取取水許可證，并繳納水資源費(fèi)，取得取水權(quán)。”2006年4月起執(zhí)行的國(guó)務(wù)院《取水許可和水資源費(fèi)征收管理?xiàng)l例》第二十八條對(duì)水資源費(fèi)管理也有相關(guān)的規(guī)定，“取水單位或者個(gè)人應(yīng)當(dāng)繳納水資源費(fèi)。取水單位或者個(gè)人應(yīng)當(dāng)按照經(jīng)批準(zhǔn)的年度取水計(jì)劃取水。超計(jì)劃或者超定額取水的，對(duì)超計(jì)劃或者超定額部分累進(jìn)收取水資源費(fèi)。”

　　在以上兩部法規(guī)的基礎(chǔ)上，《水資源費(fèi)征收使用管理辦法》對(duì)水資源費(fèi)的征收、繳庫(kù)、使用管理、違規(guī)處理等方面都做出了具體規(guī)定，水利部副部長(zhǎng)胡四一將辦法的主要內(nèi)容總結(jié)為五個(gè)方面：

　　一是明確了水資源費(fèi)征收主體和征收范圍。在征收主體方面，《辦法》明確流域管理機(jī)構(gòu)審批取水的，由取水口所在地的省級(jí)水行政主管部門(mén)代為征收，并且不得實(shí)施委托。在征收范圍方面，《辦法》明確除《條例》第四條規(guī)定不需要申領(lǐng)取水許可證的情形外，都應(yīng)按規(guī)定繳納水資源費(fèi)，減少了取水單位和個(gè)人對(duì)法定免繳水資源費(fèi)的誤解，有利于保證水資源費(fèi)征收制度的全面正確實(shí)施。

　　二是規(guī)范了水資源費(fèi)征收行為。《辦法》分別對(duì)水資源費(fèi)征收時(shí)間、取水單位和個(gè)人的實(shí)際取水量(發(fā)電量)申報(bào)、征收機(jī)關(guān)的核定和繳費(fèi)通知單的送達(dá)程序等都做出了具體明確的規(guī)定，促進(jìn)了各級(jí)水行政主管部門(mén)依法行政，強(qiáng)化了水資源費(fèi)征收工作監(jiān)管。

　　三是明確了水資源費(fèi)的使用范圍和程序，確保了專(zhuān)款專(zhuān)用。《辦法》規(guī)定，水資源費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)用于水資源的節(jié)約、保護(hù)和管理，具體包括調(diào)查評(píng)價(jià)、取水許可監(jiān)督管理、水資源調(diào)度方案的實(shí)施等九大項(xiàng)工作。在使用程序上，明確由縣級(jí)以上水行政主管部門(mén)會(huì)同有關(guān)部門(mén)編制水資源費(fèi)收支預(yù)算，并納入部門(mén)預(yù)算報(bào)同級(jí)財(cái)政部門(mén)審核，資金支付按照財(cái)政國(guó)庫(kù)管理制度規(guī)定執(zhí)行。

　　四是明確了中央與地方水資源費(fèi)的解繳比例。在充分考慮中央與地方、地方與地方之間在水資源管理、節(jié)約和保護(hù)事權(quán)劃分的基礎(chǔ)上，《辦法》明確規(guī)定中央與地方按照1：9進(jìn)行水資源費(fèi)解繳，即縣級(jí)以上地方人民政府水行政主管部門(mén)征收的水資源費(fèi)首先解繳中央財(cái)政10%，剩余的90%再在地方各級(jí)財(cái)政之間進(jìn)行分配。

　　五是加強(qiáng)了水資源費(fèi)征收使用管理的監(jiān)督。對(duì)此，《辦法》規(guī)定，水資源費(fèi)的征收使用必須接受價(jià)格、財(cái)政、審計(jì)部門(mén)的檢查，各級(jí)水行政主管部門(mén)也必須加強(qiáng)對(duì)下級(jí)水行政主管部門(mén)監(jiān)督檢查。

　　胡四一還指出，水資源是重要的基礎(chǔ)性自然資源和戰(zhàn)略性經(jīng)濟(jì)資源，是生態(tài)與環(huán)境的重要控制性要素。水資源有償使用制度是1988年《水法》設(shè)立的一項(xiàng)促進(jìn)水資源節(jié)約、保護(hù)和管理的重要制度，為促進(jìn)水資源的可持續(xù)利用提供了有力保障。